Vojtěch Novotný působí jako pedagog na Katedře plánování krajiny a sídel Fakulty životního prostředí České zemědělské univerzity v Praze. Odborně se věnuje územnímu plánování a otázkám rozvoje měst a krajiny.
Je spoluautorem certifikované metodiky pro plánování obytné funkce a veřejné infrastruktury ve městech, která procházejí úbytkem obyvatel, metodiky hodnocení vlivu umělého světla na krajinný ráz, územních studií a územních plánů.